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一种使用短读长序列纠错长读长组装结果的方法和装置

发明专利有效专利
  • 申请号:
    CN202110452532.9
  • IPC分类号:G16B30/00;G16B50/00
  • 申请日期:
    2021-04-26
  • 申请人:
    武汉华大基因技术服务有限公司
著录项信息
专利名称一种使用短读长序列纠错长读长组装结果的方法和装置
申请号CN202110452532.9申请日期2021-04-26
法律状态实质审查申报国家中国
公开/公告日2021-06-22公开/公告号CN113012758A
优先权暂无优先权号暂无
主分类号G16B30/00IPC分类号G;1;6;B;3;0;/;0;0;;;G;1;6;B;5;0;/;0;0查看分类表>
申请人武汉华大基因技术服务有限公司申请人地址
湖北省武汉市武汉东湖新技术开发区高新大道666号武汉国家生物产业基地项目B、C、D区研发楼B2栋 变更 专利地址、主体等相关变化,请及时变更,防止失效
权利人武汉华大基因技术服务有限公司当前权利人武汉华大基因技术服务有限公司
发明人邓天全;杨林峰
代理机构深圳鼎合诚知识产权代理有限公司代理人李小焦;彭家恩
摘要
本申请公开了一种使用短读长序列纠错长读长组装结果的方法和装置。本申请的方法包括,切割步骤,以固定阈值对长读长组装结果进行切分,获得切分后的长读长组装结果;以及后续的基于切分后的长读长组装结果进行的长读长组装结果建库步骤、比对步骤、比对结果匹配步骤、比对结果转换和排序步骤、比对结果建库步骤、长读长组装结果纠错步骤,最终合并纠错结果,获得纠错后的长读长组装结果。本申请的方法,可使用小内存节点进行纠错,大幅降低了内存峰值,解决没有大内存节点无法进行纠错的问题,降低了长度长组装结果的纠错成本;并且,在资源充足情况下,本申请的纠错方法和装置还可以并行执行,降低执行时间,提供纠错效率。

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