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一种基于图卷积和词向量的药物-靶标相互作用预测方法

发明专利有效专利
  • 申请号:
    CN201910460463.9
  • IPC分类号:--
  • 申请日期:
    2019-05-30
  • 申请人:
    湖南大学
著录项信息
专利名称一种基于图卷积和词向量的药物-靶标相互作用预测方法
申请号CN201910460463.9申请日期2019-05-30
法律状态实质审查申报国家中国
公开/公告日2019-09-27公开/公告号CN110289050A
优先权暂无优先权号暂无
主分类号暂无IPC分类号暂无查看分类表>
申请人湖南大学申请人地址
湖南省长沙市岳麓区麓山南路1号 变更 专利地址、主体等相关变化,请及时变更,防止失效
权利人湖南大学当前权利人湖南大学
发明人全哲;郭燕;林轩;何楠;王梓旭
代理机构深圳市兴科达知识产权代理有限公司代理人王翀;阳江军
摘要
本发明提供了一种基于图卷积和词向量的药物-靶标相互作用预测方法,从药物中提取分子指纹特征和邻接矩阵特征,然后利用图卷积训练这些特征,将一个蛋白质分子表达式3个一组切割,并用一个100维的向量表示这一组,利用CNN训练靶标的词向量特征,最后把训练好的药物和靶标结合在一起,进行最后的结果预测。本发明的有益效果如下:可以提供关于药物的更多特征,从而达到更高的准确性;利用词向量构建蛋白质特征,大大减少了构建特征的时间;可以完整保存药物分子图的有关信息,而不会损失特征;可以大大加快训练时间。

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