一种预测siRNA沉默效率的方法

发明专利有效专利

申请号：
CN202010729971.5
IPC分类号：G16B20/30;G16B40/00;G06N3/04
申请日期：
2020-07-27
申请人：
中国科学院计算技术研究所苏州智能计算产业技术研究院

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著录项信息

专利名称	一种预测siRNA沉默效率的方法
申请号	CN202010729971.5	申请日期	2020-07-27
法律状态	暂无	申报国家	中国
公开/公告日	2020-11-24	公开/公告号	CN111986730A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G16B20/30	IPC分类号	G;1;6;B;2;0;/;3;0;;;G;1;6;B;4;0;/;0;0;;;G;0;6;N;3;/;0;4查看分类表>
申请人	中国科学院计算技术研究所苏州智能计算产业技术研究院	申请人地址	江苏省苏州市苏州工业园区金鸡湖大道88号人工智能产业园D1单元变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	中科苏州智能计算技术研究院	当前权利人	中科苏州智能计算技术研究院
发明人	徐迪;张佩珩
代理机构	南京苏科专利代理有限责任公司	代理人	暂无

摘要

本发明揭示了一种预测siRNA沉默效率的方法，其特征在于在输入层设置特征提取模块对数据集进行特征提取和处理，使用多模motif输入结合词向量预训练模型获得序列词向量、循环神经网络提取序列的潜在特征并引入注意力模型，利用逻辑回归模块计算得到siRNA沉默效率的预测结果。应用本发明预测siRNA沉默效率的技术解决方案，通过训练得到神经网络模型能提高对输入序列进行预测的效率，为实验人员提供效率上的参考，减少试验次数，降低时间与金钱成本；有利于实现沉默效率预测的量化，并提升预测准确度，模型预测效果在Husken数据集上PCC值达到0.716。

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该专利没有引用任何外部专利数据！

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